1975年12月10日，经中共江西省委批准，将江西省农业科学研究所与江西省农业干部亚搏全站手机客服端合并成立了亚搏全站手机客服端，隶属江西省农业厅。王希仁任党委书记兼院长。行政管理设4处1室，即政治处、科研处、生产处、总务处和办公室。专业机构设作物研究所、植保研究所、果树研究所、畜牧兽医研究所、农机试验鉴定站、菌种站、情报资料室、农技干部短训班。厅直属良种繁殖场（南昌县横岗）、红壤研究所（进贤县张王庙）、水产研究所（南昌市郊叶楼）、棉花研究所（九江县港口）、蚕桑茶叶研究所（南昌县梁家渡）、养蜂研究所（南昌县伍农岗）等单位，均加冠亚搏全站手机客服端的名称。1978年9月26日，经上级批准，创办江西省农科院农业科技大学，后改名为江西省农科院大专班，从江西共大总校分拨208名新生，设有5个专业，大专班只招收过一届学生，1981年7月毕业后停办。1980年10月27日省农科院农技干部短训班划归省农业厅直接领导。
1986年2月25日，经省委常委会研究，同意将省农业科学院升格为副厅（局）级机构，仍隶属省农牧渔业厅。院内外机构进一步调整为11所，均为省级独立科研机构。罗盛槐任院党委书记，刘勋任院长。1988年2月1日，经江西省机构编制委员会批准，院机关设办公室（含保留保卫科牌子）、劳动人事处、科研处、计财处、总务处五个副处级机构，院内研究所设水稻研究所、耕作栽培研究所、旱作研究所、植物保护研究所、园艺研究所、畜牧兽医研究所、农业经济研究所共七个研究所，定为相当于副处级机构。1988年4月7日，经江西省机构编制委员会批准，院内科技情报研究所、菌种站、农机试验鉴定站、综合实验室四个机构，均定为副处级机构。1994年9月成立蔬菜花卉研究所。全院有职工668人，其中科技干部313人，工人355人，在科技干部中有研究员8人，副研究员57人，助理研究员99人。全院拥有房屋建筑面积32798平方米，试验基地738亩，其中水田283.2亩,旱地150.9亩，果园地249.8亩,饲料地49亩,鱼塘28.9亩,试验猪舍10栋(1186平方米),网室1059平方米,拥有20世纪80年代先进分析仪器13台（件）,各专业所有较齐全的常规仪器设备1000余件,馆藏图书期刊16万余册。
1995年3月25日，省委常委会研究，同意将省农业科学院改为直属省政府领导的正厅级事业单位。1995年4月3日，颜龙安同志任院长，5月10日，颜龙安同志任党委书记。1995年8月28日，经省机构编制委员会办公室审核，并报省人民政府批准，院机关设6个处（室）和直属机关党委（后经请示仍设党委办公室）。院内12个科研机构，均为正处级机构。原子能应用研究室改为原子能应用研究所（副处级单位）。1995年9月8日，设立纪律检查委员会，年底设立监察室（正处级）。经省编委同意，1996年12月，成立“亚搏全站手机客服端生物工程中心”，挂靠在测试所。1999年成立“食品加工研究开发中心”，挂靠测试所。1997年9月“农业部肉及肉制品质量监督检验测试中心”通过国家计量认证和农业部的审查验收，授权开展肉及肉制品的质量检测工作。2000年，院生产管理处更名为院科技开发处。2000年底“江西省农科院绿色食品环境检测中心”通过了省计量认证，授权开展绿色食品生产环境的检测工作。2001年5月，经国家绿色食品发展中心授权成立“绿色食品产品质量监测中心（南昌），承担江西省和邻省的绿色食品的申报检验和监督抽查检验任务。2002年，省质量技术监督局同意“江西省农副产品质量监督检验站”正式更名为“江西省无公害农产品质量监督检验站”。2003年农业部质量安全中心授权成立全国首批江西省唯一一家“无公害农产品安全检测机构”。2003年7月“江西省农业工程咨询中心”成立。2003年12月，经国家环境保护总局批准获得建设项目环境影响评价资格，成立“亚搏全站手机客服端环境评价中心”。至2003年底，全院共有13个研究所，1个研究中心，9个机关处（室）机构。全院共有在职职工602人，其中具有职称的科技人员380人，研究员25人，副研究员89人，中级124人，博士12人（其中在读7人），硕士16人，大学本科163人，专科97人，中专71人，人才梯队基本形成。在科研设施方面，先进的仪器和设施条件逐步提高，拥有气相色谱仪、液相色谱仪、原子吸取分光光度计、原子荧光光谱仪、紫外分光光度计、高速冷冻离心机等先进精密仪器。建有先进的人工气候室和高标准的试验基地。在南昌市民营科技园区建有50万居里的CO60辐照装置。2002年建成江西省作物遗传育种重点实验室，装备有先进的生物工程研究仪器，为开展农业高新技术的研究打好了基础。同时基本建设也成倍增长，1980—2003年，全院兴建综合实验室楼、旱作植保研究所办公楼、水稻研究所办公楼、海南育种基地、畜牧研究所办公楼、院机关办公楼、作物遗传育种重点实验室等科研设施工程总建筑面积22100平方米；共建职工宿舍24栋，建筑面积32642平方米，职工住房条件逐步得到改善。
