民国二十三年(1934)3月6日,在原有的农事试验场、林场、农艺专科亚搏全站手机客服端及农科职业亚搏全站手机客服端的基础上合并组建了江西省农业院,隶属江西省政府。开始在南昌农事试验总场内办公,院址后来设在南昌县莲塘伍农岗,董时进为第一任院长。
江西省农业院创建之初,全院有科技人员112人,其中技师15人,技士26人,技佐28人,经济研究员2人。院内设5部1处,5部为:(1)农业推广部,分设农事、家事两个组;(2)植物生产部,分设作物、园艺、昆虫、森林、农业化学、农业工程、农业经济;(3)动物生产部,分设畜牧、兽医两个组;(4)农业教育部;(5)农业经济部;1处为总务处,分设会计、杂务、文书、出纳、图书5股。江西省农业院还在南昌、宜春、南城、吉安、上饶、赣县、宁都、浮梁8个行政区设立推广处。同时创建江西省兽医专科亚搏全站手机客服端1所,永修高级农林职工亚搏全站手机客服端1所。1938年,院内取消部、处,改设3科、3室。1935—1938年,在全省各自然生态区先后分设十九个农场。抗战爆发后,1938年秋季,日军侵入江西,赣北沦陷,沦陷区内试验场站破坏殆尽。农业院随省政府南迁吉安,1939年迁到泰和,1943年日军侵占吉安、泰和时,又搬迁到宁都,1945年抗日战争胜利后,江西省农业院迁回南昌莲塘伍农岗原址。首先恢复莲塘农事试验总场与南关口分场、永修棉场,新增设九江示范农林场和畜牧场,南昌农业辅导区与耕牛防疫队。省立农业专科亚搏全站手机客服端与兽医专科亚搏全站手机客服端也相继迁来南昌,1947年两校划归教育厅管辖。此时农业院经费减少,机构收缩,大部分农业试验场、园和苗圃均移交给地方管理。